La CLAP a pour mission d’assumer et promouvoir, sur une base participative et en partenariat avec le MRNF, la conservation, le développement et la mise en valeur des poissons du lac Saint-Jean, particulièrement à l’égard de la ouananiche dont la renommée déborde largement les frontières régionales. Plus spécifiquement, la CLAP assure le suivi annuel de la pêche sportive estivale au lac Saint-Jean (ouananiche et doré); elle protège les frayères à doré les plus vulnérables au printemps; elle protège les rivières à ouananiche durant la montaison et la fraye; elle contribue à la restauration, au développement et à la mise en valeur des ressources halieutiques et leurs habitats; elle réalise et/ou supporte des projets d’acquisition de connaissances sur la ouananiche, le doré, l’éperlan et leurs habitats; elle informe et sensibilise la clientèle.